Typ: Klaster na procesorach Itanium 2 Nazwa sieciowa: holk.task.gda.pl

Ogólna charakterystyka

Typ	Klaster na procesorach Itanium 2
Nazwa	holk
Adres IP	192.168.x.x
Procesory	Intel Itanium II 1.3/1.4 GHz, 3 / 4 MB Cache L3, architektura EPIC, liczba procesorów: 256
Pamięć operacyjna	640 GB
Pamięć dyskowa	5.7 TB
Architektura	klaster maszyn SMP z siecią Gigabit Ethernet/InfiniBand
Sieć	po 2 porty Gigabit Ethernet na nodzie, switche D-Link
System operacyjny	Debian GNU/Linux, wersja 3.0

Opis

Klaster zbudowany jest z modułów w architekturze SMP. Każdy moduł zawiera po dwa procesory Itanium2, 2 GB pamięci operacyjnej, 36 GB dysk twardy SCSI, oraz dwa porty Gigabit Ethernet. Aktualnie moduły są podłączone za pomocą pojedyńczego łącza do switchy gigabitowych firmy D-Link.

Moduły pracują po kontrolą systemu operacyjnego Debian GNU/Linux 3.0. Do komunikacji wykorzystywana są biblioteki MPICH i LAM.

Klaster jest wykorzystywany głównie do symulacji dużych biomolekuł i fazy skondensowanej na poziomie dynamiki molekularnej oraz kwantowomechanicznym.

W sierpniu 2004 pamięć operacyjna klastra została zwiększona poprzez dołożenie do połowy nodów 4 GB pamięci

Od listopda 2004 w skład klastra holk wchodzi podklaster clusterix złozóny z 16 węzłów wyposażonych w 2 procesory Itanium2 1.4 GHz oraz sieć InfiniBand. Tabela pokazuje parametry zbiorcze całego klastra.

Teoretyczna moc obliczeniowa klastra wynosi 1510 GFlop/s

Zainstalowane oprogramowanie użytkowe

amber, crystal, gamess, gaussian, icc, ifort, nwchem, vasp,