Moldy (MOLecular DYnamics simulation code) jest programem chemicznym. Służy on do symulacji fazy skondensowanej, metodą klasycznej dynamiki molekularnej. Program pozwala wykonywać obliczenia dla dowolnego zbioru sztywnych molekuł, jonów i atomów w zespołach NVT lub N-sigma-T (z wykorzystaniem metody Parrinello-Rahmana). Siły krótkozasięgowe liczone są metodą cel połączonych, a długozasięgowe metodą Ewalda. Program dopuszcza potencjały Lennarda-Jonesa, 6-exp, Buckinghama-Borna-Meyera, MCY i 4-6-8-12-exp. Łatwo można dodać inne typy potencjałów.