Centrum Informatyczne Trójmiejskiej Akademickiej Sieci Komputerowej

MOPAC

To jest materiał archiwalny. Zawartość tej strony nie jest aktualizowana.

MOPAC jest pakietem do obliczeń z zakresu chemii kwantowej przy wykorzystaniu metod półempirycznych.


Funkcje pakietu

  • Obliczenia funkcji falowych metodami półempirycznymi MNDO, MINDO/3, AM1, PM3, MNDO-d w schematach SCF RHF, ROHF, UHF oraz CI.
  • Obliczenia energii i komponentów energii dla atomów, cząsteczek, polimerów i ciał stałych (warunki periodyczne).
  • Optymalizacja (również częściowa) geometrii cząsteczek oraz (w warunkach periodycznych) polimerów i ciał stałych.
  • Obliczania poszukiwania punktów siodłowych na scieżkach reakcji.
  • Aplikacja właściwości symetrycznych molekuł w obliczeniach energii, optymalizacji geometrii oraz w obliczeniach czętości drgań własnych.
  • Wczytywanie i wypisywanie informacji o współrzędnych geometrycznych w formacie PDB.
  • Obliczenia właściwości cząsteczek: rzędowości wiązań, ładunków Coulsona i Mullikena, momentów dipolowych, polaryzowalności, właściwości optycznych i potencjału elektrostatycznego.
  • Uwzględnienie w obliczeniach obecności rozpuszczalnika metodami COSMO lub MST.
  • Obliczenia ewolucji układu w czasie (dynamika molekularna) w schemacie NVE.
  • Istnieje możliwość używania interfejsu graficznego (Cache), ale jest on własnością właściciela licencji (patrz niżej). Wyniki obliczeń programu można częściowo wizualizować przy pomocy popularnych programów tj, Rasmol, Molden, gOpenMol.


Istotne informacje

  • Pakiet jest zainstalowany na komputerach: galera
  • Wersja: 2000
  • Katalog instalacji /apl/mopac
  • Pomoc, dokumentacja: podręcznik elektroniczny
  • Ostatnia aktualizacja pakietu: 2001
  • Status licencji: licencja należy do Zakładu Modelowania Molekularnego, Wydział Chemii UG.
  • Konsultant TASK: Maciej Bobrowski
  • Słowa kluczowe: chemia kwantowa, metody półempiryczne
  • Strona producenta: Fujitsu


Oprogramowanie naukowe

Oprogramowanie na Klastrze Pentium III Xeon SCI (Galera)