W CI TASK właśnie rozpoczynają się warsztaty "Archiwizacja danych w środowisku naukowym. Transmisję z tego wydarzenia można śledzić na żywo w internecie pod adresem http://153.19.250.105/streaming.html?conference_id=004858107001002. Na stronie serwera, w polu Sign-in name należy wpisać swoje imię, strona nie wymaga hasła.

Przy siedzibie Centrum dobiegają właśnie końca prace przy instalacji agregatu prądotwórczego, będącego częścią nowego systemu gwarantowanego zasilania dla węzła sieciowego i serwerów obliczeniowych TASKu. Nowy agregat ma moc 800 kVA i będzie drugim takim urządzeniem na wyposażeniu TASKu. Wraz z zespołem zasilaczy UPS, oraz systemem klimatyzacji pozwoli na zainstalowanie w naszych serwerowniach nowych urządzeń. Przy aktualnej wydajności obliczeniowej z kilowata daje to potencjał do ponad dwukrotnego zwiększenia mocy obliczeniowej zasobów CI TASK.

Zapraszamy Państwa do udziału w warsztatach dotyczących usługi powszechnej archiwizacji realizowanej w ramach projektu Platon.

Tematyka warsztatów to:

• zabezpieczanie danych przed utratą lub zniszczeniem
• bezpieczne i wiarygodne wykonywanie kopii zapasowych i archiwalnych

Adresatami warsztatów są:

• instytucje naukowe i edukacyjne
• pracownicy uczelni, naukowcy, studenci
• inne instytucje

Osoby i jednostki zainteresowane uczestnictwem w warsztatach prosimy o zapoznanie się załączoną ulotką i ewentualne zarejestrowanie się przez wysłanie e-maila na adres: m.bialoskorski@task.gda.pl

W dniu 12 maja o godz. 12 odbędzie się w siedzibie CI TASK miniseminarium pt. "Hybrid technologies for parallel computing" poświęcone zastosowaniom nowych technologii w związku z obliczeniami masowo równoległymi przy użyciu układów graficznych NVIDIA i ATI, oraz technologii CUDA/FERMI wraz przykładami programowania w języku C. Wykład poprowadzi dr Piotr Arłukowicz z Uniwersytetu Gdańskiego.

Wszystkich zainteresowanych serdecznie zapraszamy na spotkanie. Ze względu na ograniczoną ilość miejsc prosimy o e-mailową rejestrację udziału w seminarium pod adresem bart@task.gda.pl

Centrum Informatyczne TASK pełni rolę regionalnego operatora usługi eduroam adresowanej do środowiska naukowego (http://www.eduroam.pl). W związku z tym chcielibyśmy Państwa zaprosić na spotkanie wprowadzające oraz przybliżające samą ideę eduroam oraz prezentujące w jaki sposób Państwa Jednostka mogłaby z tej usługi korzystać.

Spotkanie rozpocznie się 12 marca 2010 r. o godzinie 10:00 w siedzibie Centrum Informatycznego TASK - III piętro prawego skrzydła nowego budynku WETI Politechniki Gdańskiej.

Ramowy program spotkania przedstawia się następująco:

1. eduroam - wprowadzenie
2. Prezentacja działania eduroam
3. Prezentacja wdrożenia usługi na Uniwersytecie Gdańskim
4. Pytania, dyskusja.

Jak co roku przypominamy użytkownikom Komputerów Dużej Mocy od obowiązku złożenia rocznego sprawozdania z wykorzystania zasobów TASK.

Więcej informacji na ten temat w dziale sprawozdania. Bezpośrednie przejście do formularza

Nowa odsłona strony WWW TASKu. Zmieniono wystrój oraz zreorganizowano układ treści. Dołączono również zawartość dawnego serwisu wiki.task.gda.pl. Poprzednia wersja serwisu jest dostępna pod adresem www-old.task.gda.pl, serwis wiki pod wiki-old.task.gda.pl

W ostatnich dniach zostały wprowadzone zmiany w organizacji dostępu do serwera kdm.task.gda.pl oraz do poszczególnych superkomputerów. Zmienił się także serwer licencji oprogramowania Matlab. Więcej szczegółów można znaleźć w archiwum listy kdm-users gdzie są wysyłane komunikaty o bieżących pracach: http://lists.task.gda.pl/pipermail/kdm-users/2009-December/thread.html

Po kamerze Górkach Zachodnich uruchamiany kolejną transmisję wideo, tym razem z Mariny w Gdyni Widok z kamery można oglądać na stronie http://www.task.gda.pl/uslugi/stream/kamera_gdynia_marina/

W imieniu firmy Oprogramowanie Naukowo-Techniczne zapraszamy Państwa na seminarium techniczne: "Przetwarzanie sygnałów i telekomunikacja".

Seminarium odbędzie się 19 maja 2009 r. w siedzibie CI TASK (nowy budynek Wydzialu ETI Politechniki Gdańskiej).

Uczestnictwo w seminarium jest bezpłatne. Prosimy o wczesniejsza rejestracje na stronie www.ont.com.pl (liczba miejsc jest ograniczona). Rozpoczecie o 9:45.

Więcej informacji znajdą Państwo na http://www.ont.com.pl/seminarium.php?id=gdansk

W ramach prac pilotażowych projektu MAYDAY uruchomiono transmisję strumienia wideo z kamery zainstalowanej nad przystanią Narodowego Centrum Żeglarstwa w Górkach Zachodnich. Widok z kamery można oglądać na stronie http://www.task.gda.pl/uslugi/stream/kamera_gorki_zach/

W serwerowni Centrum dobiegają właśnie końca prace związane z instalacją nowego systemu składowania danych roboczych. Instalacja ta opiera się na klastrowym systemie plików Lustre. Ideą takiego systemu jest zapewnienie wspólnej dyskowej przestrzeni roboczej dla dużego klastra obliczeniowego. Realizuje się to, w odróżnieniu od tradycyjnych systemów plików jak NFS, nie za pomocą jednego centralnego serwera danych, ale poprzez połącznie grupy serwerów z dołączonymi macierzami dyskowymi w jeden zespół udostępniający zasób dyskowy dla klastra. Rozwiązanie to zapewnia wydajność operacji zapisu i odczytu nieosiągalną dla pojedynczych serwerów i macierzy - nawet wysokiej klasy, pozwalając jednocześnie uzyskać przestrzeń dyskową o pojemności rzędu petabajtów.

Instalacja taskowa oparta na rozwiązaniu firmy Polcom i składa się z 12 serwerów danych wraz z prostymi macierzami dyskowymi, pięciu serwerów metadanych i usługowych oraz szybkiej macierzy dyskowej wysokiej klasy. Pojemność całego systemu to ponad 520 TB, a szybkość operacji zapisu i odczytu do 10 GB/s.

Obecnie trwa strojenie parametrów systemu do optymalnej współpracy z klastrem obliczeniowym Galera. Wkrótce odbędzie sie uroczyste oddanie systemu do użytku.

Właśnie rozpoczął się w TASKu kurs programu Blender3D. Więcej informacji na stronie kursu

18 czerwca została ogłoszona 31 edycja listy TOP500 - listy pięciuset największych komputerów świata. Klaster Galera zainstalowany w CI TASK został na niej umieszczony na 45 miejscu . Klaster ten oparty jest na procesorach Intel Xeon Quad-Core oraz szybkiej sieci InfiniBand. Klaster posiada w sumie ponad 5000 rdzeni obliczeniowych.

Teoretyczna wydajność maszyny wynosi 50 TFLOPS, wydajność rzeczywista – zmierzona za pomocą testu HPL (High Performance LINPACK) – wynosi 38,17 TFLOPS, a więc 80% warto rzeczywistej. Zdolność obliczeniowe Galery czynią z niego najszybszy superkomputer w Polsce i regionie,

„Galera” jest wykorzystywana przez polskie uczelnie w wielu projektach badawczych, obejmujących zagadnienia z różnych dziedzin: chemii, fizyki, inżynierii, elektroniki i oceanografii. Superkomputer będzie wykorzystywany między innymi w projektach badawczych nad substancjami mogącymi znaleźć zastosowanie w terapii antynowotworowej, badaniach nad aerodynamiką w przemyśle lotniczym oraz badaniach nad przypływami i odpływami wód morskich.

Oprócz Galery z polskich superkomputerów na liście znalazły się jeszcze klaster Nova z wrocławskiego WCSSu oraz klaster firmy ABC Data

Już po raz piąty CI TASK współorganizuje konferencję naukową Infobazy, tym razem pod hasłem "Systemy-Aplikacje-Usługi" Trwają intensywne przygotowania, a szczegóły można sledzić na stronie Konferencji: http://www.infobazy.gda.pl/

Przeniesieniem częsci administracyjne zakończyła się przeprowadzka Centrum do nowej siedziby. Centrum Informatyczne TASK miesci się teraz w nowowybudowanym gmachu Wydziału ETI PG.

W semestrze letnim na Wydziale Chemii Uniwersytetu Gdańskiego będą się odbywać zajęcia z podstaw programowania równoległego z użyciem bibliotek MPI. Zajęcia będą składać się z wykładów i ćwiczeń laboratoryjnych, które można będzie wykonywać zdalnie. Zainteresowanych studentów, doktorantów i pracowników trójmiejskich uczelni prosimy o wypełnienie i przesłanie zalączonego formularza zgłoszeniowego na adres adam@chem.univ.gda.pl

Zajęcia będą odbywały się w poniedziałki w godzinach 8-11 w sali 401 Wydziału Chemii UG. Pierwsze zajęcia (wykład) odbędą się w dniu 25.02.08

Program kurs będzie zbliżony do programu kursu MPI w roku akademickim 2002/2003

Równolegle i niezależnie w Instytucie Informatyki UG odbędzie sie kurs "Advanced Parallel Computing and Programming" prowadzony przez prof. Janusza Kowalika. Więcej na ten temat.

Przypominamy użytkownikom Komputerów Dużej Mocy od obowiązku złożenia rocznego sprawozdania z wykorzystania zasobów TASK.

Więcej informacji na ten temat w dziale sprawozdania . Bezpośrednie przejście do formularza

Dzięki wymianie procesorów na dwurdzeniowe moc obliczeniowa klastra Holk wzrosła ponad dwukrotnie. Teoretyczne moca obliczeniowa całego klastra wynosi teraz 3,2 TFlops, w stosunku do 1,5 TFlops w poprzedniej konfiguracji.

Klaster ma 288 procesorów dwurdzeniowych Itanium2 (łącznie 576 rdzeni obliczeniowych). Nowe procesory są taktowane zegarem 1,4 GHz i posiadają 12 MB pamięci podręcznej L3.

W dniu dzisiejszym nastąpiło całkowite wyłączenie usługi W3Cache przez CI TASK. W związku z rosnącą wydajnością sieci oraz zwiększającą się liczbą dynamicznych stron WWW korzystanie z usługi W3Cache staje się zbędne.

Usługa W3Cache pozwalała na przyspieszenie przeglądania stron WWW poprzez przechowywanie kopii stron w pamięci serwera zlokalizowanego w sieci bliżej użytkownika niż serwer źródłowy. Pozwalała także oszczędzać pasmo w przypadku przeglądania tych samych stron przez wielu użytkowników.

Przypominamy użytkownikom Komputerów Dużej Mocy od obowiązku złożenia rocznego sprawozdania z wykorzystania zasobów TASK.

Więcej informacji na ten temat w dziale sprawozdania . Bezpośrednie przejście do formularza

Z satysfakcją informujemy, że prezentacja jednego z naszych użytkowników, Macieja Harańczyka została wyróżniona przez Division of Chemical Information American Chemical Society oraz firmę farmaceutyczna FIZ-Chemie. W oparciu o przedstawiony "poszerzony abstrakt" przyznano mu stypendium na uczestnictwo we wrześniowej konferencji ACS w San Francisco. Jego poster będzie oznaczony plakietką "award winner". Tego typu nagród jest przyznawanych 3-5 na każdej konferencji ACS. Wyróżniona praca jest realizowana przez Macieja Harańczyka w Gdańsku jako główny wątek jego pracy doktorskiej. Promotorem pracy doktorskiej jest prof. Maciej Gutowski. Obliczenia wykonywane są głównie na superkomputerach TASK-u.

Maciej Harańczyk jest doktorantem Wydziału Chemii Uniwersytetu Gdańskiego. Jego zainteresowania skupiają się na zagadnieniach związanych z rozwiązywaniem problemów chemicznych przy pomocy komputerów. W ostatnim czasie jego badania skupione były na opracowaniu metodologii i jej zastosowaniu do charakteryzacji uszkodzonych fragmentów DNA. Swoje obliczenia na superkomputerach TASK prowadzi od 2000 roku.

American Chemical Society (ASC) jest największym towarzystwem naukowym na świecie. Organizatorzy przewidują, że we wrześniowym zjeździe tej organizacji w San Francisco weźmie udział 12,5 tys. naukowców.

Dokładny odnośnik do prezentacji: Maciej Haranczyk, Maciej Gutowski - "Quantum Mechanical Energy-Based Screening of Combinatorially Generated Library of Tautomers", The 2006 ACS Fall National Meeting, Sept. 10-14, San Francisco, CA, USA.

Klaster Holk, zainstalowany w Centrum Informatycznym Trójmiejskiej Akademickiej Sieci Komputerowej na Politechnice Gdańskiej, przekroczył granicę rzeczywistej wydajności 1 biliona operacji na sekundę, uzyskując w pierwszych dniach stycznia 2006 roku, w teście HPLinpack, wynik 1,117 Tflop/s (Teraflopa). Wynik ten oznacza, że komputer w ciągu jednej sekundy jest w stanie wykonać praktycznie ponad bilion operacji zmiennoprzecinkowych

Jest to najlepszy wynik uzyskany dotąd w Polsce przez superkomputer przeznaczony do zastosowań naukowych.

Klaster komputerowy jest rodzajem superkomputera zbudowanego z mniejszych serwerów tzw. węzłów połączonych dedykowaną (tzn. specjalnie wydzieloną) siecią, pracujących razem tak jakby to był jeden komputer. Klaster o nazwie Holk nie jest nową instalacją - został oddany do użytku w 2003 roku w Centrum Informatycznym Trójmiejskiej Akademickiej Sieci Komputerowej na Politechnice Gdańskiej. Oparto go o 256 procesorów Intel Itanium 2 i systemie operacyjnym Linux, a jego sumaryczną, teoretyczną moc obliczeniową oszacowano na 1,3 biliona operacji zmiennoprzecinkowych na sekundę, jednak w konkretnych aplikacjach nie uzyskuje się takiej wydajności. Przyjmuje się natomiast, że dobre odzwierciedlenie rzeczywistej mocy obliczeniowej daje test HPL (High-Performance Linpack). Jest to program matematyczny rozwiązujący układ równań o bardzo dużej liczbie niewiadomych. Czas w jakim komputer jest w stanie wykonać to zadanie pokazuje jego moc obliczeniową. Wynik testu HPL służy klasyfikacji komputerów na liście najszybszych komputerów świata TOP500.

Po zainstalowaniu w 2003 roku HOLK znalazł się na prestiżowej liście superkomputerów TOP500 z wynikiem 641 Gflop/s (Gigaflop - miliard operacji/sek.). Uzyskanie na nim rzeczywistej wydajności 1 Tflop/s stało się możliwe po rozbudowie do 288 procesorów, głównie jednak dzięki zainstalowaniu superszybkiej sieci wewnętrznej InfiniBand. Jest to nowa generacja sieci zaprojektowana specjalnie dla zastosowań w centrach obliczeniowych do przesyłania bardzo dużych ilości danych przy jak najmniejszym opóźnieniu. Zastosowane w HOLKu rozwiązanie charakteryzuje się przepustowością 10 Gb/s, co w praktyce daje 7-krotnie większą przepływność niż w stosowanej dotychczas sieci Gigabit Ethernet oraz około 100-krotnie większą niż w typowych sieciach lokalnych. Jednak najważniejszą cechą tej sieci z punktu widzenia zastosowań klastrowych jest niskie opóźnienie przesyłanych komunikatów. Pozwala to nawet na 24-krotne zmniejszenie czasu wykonywania konkretnych aplikacji naukowych co oznacza, że wynik obliczeń, na który do tej pory czekało się np.30 dni teraz można otrzymać już po 30 godzinach.

Teoretyczna moc obliczeniowa klastra HOLK, który składa się obecnie z 288 procesorów Itanium2 i wyposażony jest w pamięć operacyjną o pojemności 640 GB oraz pamięć dyskową 5,8 TB, podwyższyła się do 1,51 Tflop/s. Całość spina sieć Gigabit Ethernet oraz sieć InfiniBand 10Gb/s. Głównym elementem sieci InfiniBand jest 144-portowy przełącznik działający w topologii fat tree, zapewniający komunikację między węzłami z pełną przepustowością. Klaster pracuje pod kontrolą systemu operacyjnego Debian GNU/Linux.