W zeszłym tygodniu w CI TASK ruszył kurs modelowania 3D w programie Blender. Zajęcia odbywają się we wtorki o godzinie 14:00 i równolegle w piątki (ten sam materiał, co we wtorek) w godzinach 15:00-17:00. Całość kursu, w postaci wideo tutoriali, udostępniana jest sukcesywnie przez prowadzącego dr Piotra Arłukowicza na stronie: polskikursblendera.pl

Obowiązującą, „kursową” wersję Blendera można pobrać z naszego serwera ftp pod adresem: http://ftp.task.gda.pl/pub/edu/blender/

przydatne linki:

• Polski Kurs Blendera
• biblioteka darmowych materiałów/tekstur
• kolejny zbiór materiałów
• obszerna biblioteka tekstur
• biblioteka darmowych modeli
• strona poświęcona wykorzystaniu Blendera w architekturze
• strona z plikami instalacyjnymi najróżniejszych wersji Blendera

Szanowni państwo, CI TASK otwiera zapisy na kolejną edycję kursu modelowania 3D w programie Blender.

Zajęcia rozpoczną się wraz z nowym rokiem (2012) i będą odbywały się raz w tygodniu w godzinach popołudniowych. Termin zajęć dopasowany będzie, w miarę możliwości, do preferencji uczestników.

Kurs poprowadzi dr Piotr Arłukowicz z Instytutu Informatyki Uniwersytetu Gdańskiego.
Zajęcia będą się odbywały w siedzibie CI TASK.

Program kursu obejmował będzie następujące zagadnienia.

1. Podstawy obsługi i źródła informacji.
2. Transformacje GRS.
3. Modyfikatory.
4. Edycja obiektów.
5. Edycja krzywych.
6. Oświetlenie sceny.
7. Proste materiały.
8. Materiały złożone.
9. Mapowanie UV.
10. Mapowanie projekcyjne i malowanie tekstur.
11. Wypalanie tekstur.
12. Dodatkowe tryby pracy.
13. Edytor nodów: postprocessing sceny i efekty specjalne
14. Podstawy animacji 3D
15. Kompozycja i edycja filmów (lub inny, wybrany temat)

Wymagania:
- własny laptop z karta graficzną ze wsparciem dla 3D.
- wskazana jest klawiatura numeryczna oraz 3-klawiszowa mysz.

Kurs jest bezpłatny i kierowany jest do studentów, doktorantów i pracowników trójmiejskich uczelni wyższych.

Zgłoszenia prosimy wysyłać korzystając z formularza zgłoszeń.

Program Blender jest doskonałym narzędziem służącym m.in do tworzenia efektownych wizualizacji danych, wizualizacji architektonicznych, animacji, gier itp.

Poniżej znajduje się film ilustrujący możliwości programu Blender:
http://www.youtube.com/watch?feature=player_embedded&v=QbzE8jOO7_0&hd=1

oprogramowanie do pobrania

plan

Klaster obliczeniowy Galera po rozbudowie zwany Galera Plus awansował na prestiżowej liście najszybszych komputerów świata TOP500 z pozycji 298 na 163. Tak duży skok był możliwy dzięki rozbudowie systemu z 2008 o nowe serwery obliczeniowe zakupione w ramach projektów Pl-Grid i Mayday EURO 2012.

Połączony klaster pracuje na ponad 1100 serwerach i zawiera niemal 11 tys. rdzeni obliczeniowych. Serwery są połączone dedykowaną siecią InfiniBand o przepustowości 40 Gb/s. System posiada 22 TB pamięci operacyjnej. Nowa instalacja posiada możliwość programowego uruchomienia serwera SMP o pamięci 4 TB.

Moc obliczeniowa klastra jest wykorzystywana do symulacji naukowych w takich dziedzinach jak chemia, fizyka, nanotechnologia, oceanologia, astrofizyka, inżynieria, meteorologia, a także wielu innych.

Superkomputery TASK mają imponującą historię na TOP500. Pierwsza maszyna Centrum znalazła się na liście już w 1995 roku, był to IBM SP/2. Następym był klaster Holk ulokowany na liście w 2003 roku, jako jedyna maszyna z Polski. W 2008 roku w rankingu po raz pierwszy znalazła się Galera i to na pozycji 46 co jest dotychczas najlepszym wynikiem komputera z Polski (Historia maszyn CI TASK na TOP500).

Na opublikowaną 20 czerwca 2011 w Hamburgu liście TOP500 oprócz maszyny CI TASK z Polski trafiły jeszcze komputery "Zeus" z ACK Cyfronet (80 miejsce), oraz systemy firm Nasza Klasa (364) i QXL Poland (480)

CI TASK serdecznie zaprasza swoich użytkowników do wzięcia udziału w podstawowym kursie programowania równoległego z użyciem bibliotek MPI. Kurs będzie miał formę trzech wykładów z ćwiczeniami do samodzielnego wykonania. Kurs jest przeznaczony dla użytkowników KDM pragnących rozpocząć zrównoleglanie swoich aplikacji a także potrzebujących lepszego zrozumienia działania aplikacji równoległych. Porządana jest podstawowa znajomość środowiska obliczeniowego komputerów TASK oraz podstaw programowania w języku C/C++ lub Fortran.

Wstępny program kursu

Częśc I
24 maja, wtorek, godz. 9.00-11.00
Wstęp, podstawy programowania równoległego

Częśc II
30 maja, poniedziałe, godz. 9.00-11.00
Podstawy komunikacji punktowej (pisanie prostego programu równoległego)

Częśc III
31 maja, poniedziałe, godz. 9.00-11.00
Komunikacja grupowa

Kurs będzie się odbywał w siedzibie CI TASK.

Kurs poprowadzi dr Piotr Arłukowicz z Instytutu Informatyki UG

Prosimy przysyłać zgłoszenie chęci udział w kursie na adres podając imię nazwisko i swój login na KDM

Aktualizacja

Materiały do kursu znadują się na stronie http://www.task.gda.pl/uslugi/kursy/mpi2011/

Informujemy o otwarciu konkursu na przydział grantu obliczeniowego w projekcie PRACE: Tier-0 oraz po raz pierwszy na wybrane maszyny w Tier-1.

Maszyny Tier-0 to : IBM Blue Gene/P “JUGENE” (GCS@Jülich, Germany); Bull BULL Bullx cluster “CURIE” (GENCI@CEA, France); Cray XE6 “HERMIT” (GCS@HLRS, Germany). W ramach Tier-1 dostępne są systemy obliczeniowe z Bułgarii, Finlandii, Francji, Niemiec, Irlandii, Włoch, Polski, Hiszpanii, Szewcjii, Holandii i Wielkiej Brytanii

Termin składania wniosków mija : 22 czerwca 2011 o godzinie 16.00 CEST

Centrum TASK jako wiodąca jednostka w zakresie sieci komputerowych od lat wdraża protokół IPv6. Do serwisów FTP, NEWS i innych dostępnych od kilku lat przez protokół IPv6, ostatnio dołączyliśmy także naszą stronę WWW. Strona jest dostępna pod adresem ipv6.task.gda.pl (do odwiedzenia tej strony konieczna jest włączona obsługa IPv6 w komputerze i u dostawcy Internetu).

Protokół IPv6 jest następcą powszechnie dziś stosowanego protokołu IPv4. Protokoły te służą do komunikacji pomiędzy komputerami w sieci Internet. Każdy komputer w sieci posiada swój adres IP ((np. adres serwera news.task.gda.pl w IPv4 to 153.19.250.122, a w IPv6 to 2001:4070:1::fafe), dzięki któremu może zostać zlokalizowany przez inne komputery. Tym samym protokoły te stanowią podwalinę współczesnego Internetu. Pula adresów IPv4 wynosi ok. 4 miliardy, jednakże w obliczu szybkiego przyrastania liczby komputerów oraz urządzeń dołączonych do sieci ilość ta przestała wystarczać. Już w tym roku prognozowane jest wykorzystanie ostatnich wolnych adresów. Dlatego też jedną z głównych cech IPv6 jest to, że oferuje on znacznie szerszą pulę adresową rzędu 10³⁴ adresów. Protokół IPv6 dostarcza także nowych mechanizmów i rozwiązań do lepszego działania wielu aplikacji w dzisiejszym i przyszłym Internecie.

Już po raz szósty Centrum współorganizuje Krajową Konferencję Naukową Infobazy 2011. Tym razem hasłem przewodnim jest "Nauka, Projekty Europejskie, Społeczeństwo Informacyjne",

Konferencja odbędzie się w dniach 5-7 września 2011 roku w Gdańsku i Sopocie. Tematyka sesji naukowych obejmie bazy danych: przyrodnicze (w tym GIS), z dziedziny nauk o ziemi, meteorologiczne, rolnicze, medyczne, fizyko-chemiczne, biochemiczne, techniczne i ekonomiczne, historyczno-humanistyczne i muzealne, artystyczne, biblioteczne i bazy wiedzy o nauce. Ponadto Konferencja obejmie zagadnienia dotyczące konstrukcji baz internetowych, rozproszonych i multimedialnych, a także bezpieczeństwa zarówno baz jak i aspektów narzędziowych.

W obecnej Konferencji uwaga będzie skupiona na aplikacjach i usługach niezbędnych w rozwoju Społeczeństwa Informacyjnego, a w szczególności na projektach europejskich, które w istotny sposób wspierają finansowo i tematycznie "Program Rozwoju Infrastruktury Informatycznej Nauki na lata 2007 – 2013", w tym tworzenie baz danych dla nauki. Zgodnie z wolą wyrażoną przez Ministerstwo Nauki i Szkolnictwa Wyższego Konferencja INFOBAZY 2011 będzie stanowić forum prezentacji stanu realizacji tych projektów, jak i zaowocuje szeregiem wspólnych inicjatyw i wniosków nowych projektów badawczych i wdrożeniowych.

Więcej szczegółów na stronie Konferencji infobazy.gda.pl

Jak co roku przypominamy użytkownikom Komputerów Dużej Mocy od obowiązku złożenia rocznego sprawozdania z wykorzystania zasobów TASK.

Więcej informacji na ten temat w dziale sprawozdania. Bezpośrednie przejście do formularza

Szanowni Państwo!

Zapraszamy na kolejne już szkolenie dotyczące dostępu i użytkowania zasobów PL-Grid, tym razem dotyczące platformy gLite. Dla wszystkich uczestników szkolenia przewidziany jest drobny upominek.

Cały czas zachęcamy również do rejestracji w portalu PL-Grid, która umożliwi państwu dostęp do ogólnopolskiej infrastruktury gridowej. Więcej informacji na temat projektu PL-Grid znajdą państwo pod adresem: http://www.plgrid.pl

Tytuł szkolenia: Podstawy obsługi gLite
termin szkolenia: poniedziałek, 13.12.2010, g. 12:00
miejsce szkolenia: CI TASK, Nowy budynek ETI
Rejestracja: http://www.task.gda.pl/f/plg10

Szanowni Państwo!

CI TASK ma przyjemność poinformować, że w ramach stałego rozwoju w naszym Centrum powstaje nowy klaster obliczeniowy, który znacząco rozszerzy dostępną dla naszych użytkowników moc obliczeniową. Budowa nowej maszyna SMP o teoretycznej mocy obliczeniowej 30 TFLOPS, jest finansowana ze środków projektu PL-Grid i zakończona zostanie na przestrzeni najbliższych kilku tygodni. Klaster będzie częścią ogólnopolskiej infrastruktury gridowej, do której dostęp można uzyskać rejestrując się w Portalu Użytkowników Infrastruktury PL-Grid pod adresem: https://konto.plgrid.pl/rejestracja/.

W związku z powyższym nasze Centrum organizuje cykl szkoleń dotyczących dostępu i użytkowania zasobów PL-Grid. Wszystkich chętnych zapraszamy do rejestracji pod adresem: rejestracja
Pierwsze szkolenie odbędzie się 8-ego listopada 2010 o godzinie 12:00 w siedzibie CI TASK.

Jednocześnie zachęcamy do rejestracji w portalu PL-Grid, która umożliwi państwu dostęp do ogólnopolskiej infrastruktury gridowej a tym samym dostęp do docelowej mocy obliczeniowej wielkości 215 Tflops i ponad 2 PB pamięci dyskowej. PLGrid oferuje również dostęp do specjalistycznego oprogramowania naukowego, szkoleń o róznym stopniu zaawansowania oraz ciągłego wsparcia technicznego dla użytkowników.
Więcej informacji na temat projektu PL-Grid znajdą państwo pod adresem: http://www.plgrid.pl

Tytuł szkolenia: System Unicore 6 - wprowadzenie do obsługi Pl-Grid,
termin szkolenia: poniedziałek, 08.11.2010, g. 12:00
miejsce szkolenia: CI TASK, Nowy budynek ETI
Rejestracja: http://www.task.gda.pl/f/plg10

W CI TASK właśnie rozpoczynają się warsztaty "Archiwizacja danych w środowisku naukowym. Transmisję z tego wydarzenia można śledzić na żywo w internecie pod adresem http://153.19.250.105/streaming.html?conference_id=004858107001002. Na stronie serwera, w polu Sign-in name należy wpisać swoje imię, strona nie wymaga hasła.

Przy siedzibie Centrum dobiegają właśnie końca prace przy instalacji agregatu prądotwórczego, będącego częścią nowego systemu gwarantowanego zasilania dla węzła sieciowego i serwerów obliczeniowych TASKu. Nowy agregat ma moc 800 kVA i będzie drugim takim urządzeniem na wyposażeniu TASKu. Wraz z zespołem zasilaczy UPS, oraz systemem klimatyzacji pozwoli na zainstalowanie w naszych serwerowniach nowych urządzeń. Przy aktualnej wydajności obliczeniowej z kilowata daje to potencjał do ponad dwukrotnego zwiększenia mocy obliczeniowej zasobów CI TASK.

Zapraszamy Państwa do udziału w warsztatach dotyczących usługi powszechnej archiwizacji realizowanej w ramach projektu Platon.

Tematyka warsztatów to:

• zabezpieczanie danych przed utratą lub zniszczeniem
• bezpieczne i wiarygodne wykonywanie kopii zapasowych i archiwalnych

Adresatami warsztatów są:

• instytucje naukowe i edukacyjne
• pracownicy uczelni, naukowcy, studenci
• inne instytucje

Osoby i jednostki zainteresowane uczestnictwem w warsztatach prosimy o zapoznanie się załączoną ulotką i ewentualne zarejestrowanie się przez wysłanie e-maila na adres: m.bialoskorski@task.gda.pl

W dniu 12 maja o godz. 12 odbędzie się w siedzibie CI TASK miniseminarium pt. "Hybrid technologies for parallel computing" poświęcone zastosowaniom nowych technologii w związku z obliczeniami masowo równoległymi przy użyciu układów graficznych NVIDIA i ATI, oraz technologii CUDA/FERMI wraz przykładami programowania w języku C. Wykład poprowadzi dr Piotr Arłukowicz z Uniwersytetu Gdańskiego.

Wszystkich zainteresowanych serdecznie zapraszamy na spotkanie. Ze względu na ograniczoną ilość miejsc prosimy o e-mailową rejestrację udziału w seminarium pod adresem bart@task.gda.pl

Centrum Informatyczne TASK pełni rolę regionalnego operatora usługi eduroam adresowanej do środowiska naukowego (http://www.eduroam.pl). W związku z tym chcielibyśmy Państwa zaprosić na spotkanie wprowadzające oraz przybliżające samą ideę eduroam oraz prezentujące w jaki sposób Państwa Jednostka mogłaby z tej usługi korzystać.

Spotkanie rozpocznie się 12 marca 2010 r. o godzinie 10:00 w siedzibie Centrum Informatycznego TASK - III piętro prawego skrzydła nowego budynku WETI Politechniki Gdańskiej.

Ramowy program spotkania przedstawia się następująco:

1. eduroam - wprowadzenie
2. Prezentacja działania eduroam
3. Prezentacja wdrożenia usługi na Uniwersytecie Gdańskim
4. Pytania, dyskusja.

Jak co roku przypominamy użytkownikom Komputerów Dużej Mocy od obowiązku złożenia rocznego sprawozdania z wykorzystania zasobów TASK.

Więcej informacji na ten temat w dziale sprawozdania. Bezpośrednie przejście do formularza

Nowa odsłona strony WWW TASKu. Zmieniono wystrój oraz zreorganizowano układ treści. Dołączono również zawartość dawnego serwisu wiki.task.gda.pl. Poprzednia wersja serwisu jest dostępna pod adresem www-old.task.gda.pl, serwis wiki pod wiki-old.task.gda.pl

W ostatnich dniach zostały wprowadzone zmiany w organizacji dostępu do serwera kdm.task.gda.pl oraz do poszczególnych superkomputerów. Zmienił się także serwer licencji oprogramowania Matlab. Więcej szczegółów można znaleźć w archiwum listy kdm-users gdzie są wysyłane komunikaty o bieżących pracach: http://lists.task.gda.pl/pipermail/kdm-users/2009-December/thread.html

Po kamerze Górkach Zachodnich uruchamiany kolejną transmisję wideo, tym razem z Mariny w Gdyni Widok z kamery można oglądać na stronie http://www.task.gda.pl/uslugi/stream/kamera_gdynia_marina/

W imieniu firmy Oprogramowanie Naukowo-Techniczne zapraszamy Państwa na seminarium techniczne: "Przetwarzanie sygnałów i telekomunikacja".

Seminarium odbędzie się 19 maja 2009 r. w siedzibie CI TASK (nowy budynek Wydzialu ETI Politechniki Gdańskiej).

Uczestnictwo w seminarium jest bezpłatne. Prosimy o wczesniejsza rejestracje na stronie www.ont.com.pl (liczba miejsc jest ograniczona). Rozpoczecie o 9:45.

Więcej informacji znajdą Państwo na http://www.ont.com.pl/seminarium.php?id=gdansk

W ramach prac pilotażowych projektu MAYDAY uruchomiono transmisję strumienia wideo z kamery zainstalowanej nad przystanią Narodowego Centrum Żeglarstwa w Górkach Zachodnich. Widok z kamery można oglądać na stronie http://www.task.gda.pl/uslugi/stream/kamera_gorki_zach/

W serwerowni Centrum dobiegają właśnie końca prace związane z instalacją nowego systemu składowania danych roboczych. Instalacja ta opiera się na klastrowym systemie plików Lustre. Ideą takiego systemu jest zapewnienie wspólnej dyskowej przestrzeni roboczej dla dużego klastra obliczeniowego. Realizuje się to, w odróżnieniu od tradycyjnych systemów plików jak NFS, nie za pomocą jednego centralnego serwera danych, ale poprzez połącznie grupy serwerów z dołączonymi macierzami dyskowymi w jeden zespół udostępniający zasób dyskowy dla klastra. Rozwiązanie to zapewnia wydajność operacji zapisu i odczytu nieosiągalną dla pojedynczych serwerów i macierzy - nawet wysokiej klasy, pozwalając jednocześnie uzyskać przestrzeń dyskową o pojemności rzędu petabajtów.

Instalacja taskowa oparta na rozwiązaniu firmy Polcom i składa się z 12 serwerów danych wraz z prostymi macierzami dyskowymi, pięciu serwerów metadanych i usługowych oraz szybkiej macierzy dyskowej wysokiej klasy. Pojemność całego systemu to ponad 520 TB, a szybkość operacji zapisu i odczytu do 10 GB/s.

Obecnie trwa strojenie parametrów systemu do optymalnej współpracy z klastrem obliczeniowym Galera. Wkrótce odbędzie sie uroczyste oddanie systemu do użytku.

Właśnie rozpoczął się w TASKu kurs programu Blender3D. Więcej informacji na stronie kursu

18 czerwca została ogłoszona 31 edycja listy TOP500 - listy pięciuset największych komputerów świata. Klaster Galera zainstalowany w CI TASK został na niej umieszczony na 45 miejscu . Klaster ten oparty jest na procesorach Intel Xeon Quad-Core oraz szybkiej sieci InfiniBand. Klaster posiada w sumie ponad 5000 rdzeni obliczeniowych.

Teoretyczna wydajność maszyny wynosi 50 TFLOPS, wydajność rzeczywista – zmierzona za pomocą testu HPL (High Performance LINPACK) – wynosi 38,17 TFLOPS, a więc 80% warto rzeczywistej. Zdolność obliczeniowe Galery czynią z niego najszybszy superkomputer w Polsce i regionie,

„Galera” jest wykorzystywana przez polskie uczelnie w wielu projektach badawczych, obejmujących zagadnienia z różnych dziedzin: chemii, fizyki, inżynierii, elektroniki i oceanografii. Superkomputer będzie wykorzystywany między innymi w projektach badawczych nad substancjami mogącymi znaleźć zastosowanie w terapii antynowotworowej, badaniach nad aerodynamiką w przemyśle lotniczym oraz badaniach nad przypływami i odpływami wód morskich.

Oprócz Galery z polskich superkomputerów na liście znalazły się jeszcze klaster Nova z wrocławskiego WCSSu oraz klaster firmy ABC Data

Już po raz piąty CI TASK współorganizuje konferencję naukową Infobazy, tym razem pod hasłem "Systemy-Aplikacje-Usługi" Trwają intensywne przygotowania, a szczegóły można sledzić na stronie Konferencji: http://www.infobazy.gda.pl/

Przeniesieniem częsci administracyjne zakończyła się przeprowadzka Centrum do nowej siedziby. Centrum Informatyczne TASK miesci się teraz w nowowybudowanym gmachu Wydziału ETI PG.

W semestrze letnim na Wydziale Chemii Uniwersytetu Gdańskiego będą się odbywać zajęcia z podstaw programowania równoległego z użyciem bibliotek MPI. Zajęcia będą składać się z wykładów i ćwiczeń laboratoryjnych, które można będzie wykonywać zdalnie. Zainteresowanych studentów, doktorantów i pracowników trójmiejskich uczelni prosimy o wypełnienie i przesłanie zalączonego formularza zgłoszeniowego na adres adam@chem.univ.gda.pl

Zajęcia będą odbywały się w poniedziałki w godzinach 8-11 w sali 401 Wydziału Chemii UG. Pierwsze zajęcia (wykład) odbędą się w dniu 25.02.08

Program kurs będzie zbliżony do programu kursu MPI w roku akademickim 2002/2003

Równolegle i niezależnie w Instytucie Informatyki UG odbędzie sie kurs "Advanced Parallel Computing and Programming" prowadzony przez prof. Janusza Kowalika. Więcej na ten temat.

Przypominamy użytkownikom Komputerów Dużej Mocy od obowiązku złożenia rocznego sprawozdania z wykorzystania zasobów TASK.

Więcej informacji na ten temat w dziale sprawozdania . Bezpośrednie przejście do formularza

Dzięki wymianie procesorów na dwurdzeniowe moc obliczeniowa klastra Holk wzrosła ponad dwukrotnie. Teoretyczne moca obliczeniowa całego klastra wynosi teraz 3,2 TFlops, w stosunku do 1,5 TFlops w poprzedniej konfiguracji.

Klaster ma 288 procesorów dwurdzeniowych Itanium2 (łącznie 576 rdzeni obliczeniowych). Nowe procesory są taktowane zegarem 1,4 GHz i posiadają 12 MB pamięci podręcznej L3.

W dniu dzisiejszym nastąpiło całkowite wyłączenie usługi W3Cache przez CI TASK. W związku z rosnącą wydajnością sieci oraz zwiększającą się liczbą dynamicznych stron WWW korzystanie z usługi W3Cache staje się zbędne.

Usługa W3Cache pozwalała na przyspieszenie przeglądania stron WWW poprzez przechowywanie kopii stron w pamięci serwera zlokalizowanego w sieci bliżej użytkownika niż serwer źródłowy. Pozwalała także oszczędzać pasmo w przypadku przeglądania tych samych stron przez wielu użytkowników.

Przypominamy użytkownikom Komputerów Dużej Mocy od obowiązku złożenia rocznego sprawozdania z wykorzystania zasobów TASK.

Więcej informacji na ten temat w dziale sprawozdania . Bezpośrednie przejście do formularza

Z satysfakcją informujemy, że prezentacja jednego z naszych użytkowników, Macieja Harańczyka została wyróżniona przez Division of Chemical Information American Chemical Society oraz firmę farmaceutyczna FIZ-Chemie. W oparciu o przedstawiony "poszerzony abstrakt" przyznano mu stypendium na uczestnictwo we wrześniowej konferencji ACS w San Francisco. Jego poster będzie oznaczony plakietką "award winner". Tego typu nagród jest przyznawanych 3-5 na każdej konferencji ACS. Wyróżniona praca jest realizowana przez Macieja Harańczyka w Gdańsku jako główny wątek jego pracy doktorskiej. Promotorem pracy doktorskiej jest prof. Maciej Gutowski. Obliczenia wykonywane są głównie na superkomputerach TASK-u.

Maciej Harańczyk jest doktorantem Wydziału Chemii Uniwersytetu Gdańskiego. Jego zainteresowania skupiają się na zagadnieniach związanych z rozwiązywaniem problemów chemicznych przy pomocy komputerów. W ostatnim czasie jego badania skupione były na opracowaniu metodologii i jej zastosowaniu do charakteryzacji uszkodzonych fragmentów DNA. Swoje obliczenia na superkomputerach TASK prowadzi od 2000 roku.

American Chemical Society (ASC) jest największym towarzystwem naukowym na świecie. Organizatorzy przewidują, że we wrześniowym zjeździe tej organizacji w San Francisco weźmie udział 12,5 tys. naukowców.

Dokładny odnośnik do prezentacji: Maciej Haranczyk, Maciej Gutowski - "Quantum Mechanical Energy-Based Screening of Combinatorially Generated Library of Tautomers", The 2006 ACS Fall National Meeting, Sept. 10-14, San Francisco, CA, USA.

Klaster Holk, zainstalowany w Centrum Informatycznym Trójmiejskiej Akademickiej Sieci Komputerowej na Politechnice Gdańskiej, przekroczył granicę rzeczywistej wydajności 1 biliona operacji na sekundę, uzyskując w pierwszych dniach stycznia 2006 roku, w teście HPLinpack, wynik 1,117 Tflop/s (Teraflopa). Wynik ten oznacza, że komputer w ciągu jednej sekundy jest w stanie wykonać praktycznie ponad bilion operacji zmiennoprzecinkowych

Jest to najlepszy wynik uzyskany dotąd w Polsce przez superkomputer przeznaczony do zastosowań naukowych.

Klaster komputerowy jest rodzajem superkomputera zbudowanego z mniejszych serwerów tzw. węzłów połączonych dedykowaną (tzn. specjalnie wydzieloną) siecią, pracujących razem tak jakby to był jeden komputer. Klaster o nazwie Holk nie jest nową instalacją - został oddany do użytku w 2003 roku w Centrum Informatycznym Trójmiejskiej Akademickiej Sieci Komputerowej na Politechnice Gdańskiej. Oparto go o 256 procesorów Intel Itanium 2 i systemie operacyjnym Linux, a jego sumaryczną, teoretyczną moc obliczeniową oszacowano na 1,3 biliona operacji zmiennoprzecinkowych na sekundę, jednak w konkretnych aplikacjach nie uzyskuje się takiej wydajności. Przyjmuje się natomiast, że dobre odzwierciedlenie rzeczywistej mocy obliczeniowej daje test HPL (High-Performance Linpack). Jest to program matematyczny rozwiązujący układ równań o bardzo dużej liczbie niewiadomych. Czas w jakim komputer jest w stanie wykonać to zadanie pokazuje jego moc obliczeniową. Wynik testu HPL służy klasyfikacji komputerów na liście najszybszych komputerów świata TOP500.

Po zainstalowaniu w 2003 roku HOLK znalazł się na prestiżowej liście superkomputerów TOP500 z wynikiem 641 Gflop/s (Gigaflop - miliard operacji/sek.). Uzyskanie na nim rzeczywistej wydajności 1 Tflop/s stało się możliwe po rozbudowie do 288 procesorów, głównie jednak dzięki zainstalowaniu superszybkiej sieci wewnętrznej InfiniBand. Jest to nowa generacja sieci zaprojektowana specjalnie dla zastosowań w centrach obliczeniowych do przesyłania bardzo dużych ilości danych przy jak najmniejszym opóźnieniu. Zastosowane w HOLKu rozwiązanie charakteryzuje się przepustowością 10 Gb/s, co w praktyce daje 7-krotnie większą przepływność niż w stosowanej dotychczas sieci Gigabit Ethernet oraz około 100-krotnie większą niż w typowych sieciach lokalnych. Jednak najważniejszą cechą tej sieci z punktu widzenia zastosowań klastrowych jest niskie opóźnienie przesyłanych komunikatów. Pozwala to nawet na 24-krotne zmniejszenie czasu wykonywania konkretnych aplikacji naukowych co oznacza, że wynik obliczeń, na który do tej pory czekało się np.30 dni teraz można otrzymać już po 30 godzinach.

Teoretyczna moc obliczeniowa klastra HOLK, który składa się obecnie z 288 procesorów Itanium2 i wyposażony jest w pamięć operacyjną o pojemności 640 GB oraz pamięć dyskową 5,8 TB, podwyższyła się do 1,51 Tflop/s. Całość spina sieć Gigabit Ethernet oraz sieć InfiniBand 10Gb/s. Głównym elementem sieci InfiniBand jest 144-portowy przełącznik działający w topologii fat tree, zapewniający komunikację między węzłami z pełną przepustowością. Klaster pracuje pod kontrolą systemu operacyjnego Debian GNU/Linux.

Przypominamy użytkownikom Komputerów Dużej Mocy od obowiązku złożenia rocznego sprawozdania z wykorzystania zasobów TASK.

Więcej informacji na ten temat w dziale sprawozdania. Bezpośrednie przejście do formularza

W dniach 25-27 września br. odbyła się Konferencji Infobazy 2005 - Bazy Danych dla Nauki współorganizowana przez CI TASK. Była to już czwarta impreza z cyklu Infobazy. Konferencja odbywała się w Akadmii Muzycznej w Gdańsku. Przybyło prawie 130 uczestników z całego kraju. Odbyło się siedem sesji naukowych, jedna sesja promocyjna, oraz dyskusja "okrągłego stołu" poświęcona rozproszonemu przechowywaniu i wyszukiwaniu danych. Wygłoszono cztery wykłady plenarne oraz 47 referatów. W rozpoczęciu Konferencji wzięli udział przedstawiciele władz Politechniki Gdańskiej, Akademii Muzycznej w Gdańsku, Instytutu Oceanologii PAN w Sopocie oraz Centrum Informatycznego TASK. Uroczystość rozpoczęcia Konferencji uświetnił koncert fortepianowy. Drugiego dnia Konferencji, po trudach obrad uczestnicy mogli się rozerwać na imprezie pod hasłem "Wieczór Piracki - w poszukiwaniu Czarnej Perły", która odbyła się w Muzeum Morskim.

Przygotowania do tegorocznej edycji Konferencji Infobazy - Bazy Danych dla Nauki idą pełną parą. Zakończono już przyjmowanie zgłoszeń referatów. Trwją ostatnie prace redakcyjne nad książką konferencyjną. Został przygotowany wstępny program obrad. Planowane jest zaprezentowanie ponad piećdziesięciu referatów i wykładów na temat baz danych bibliotecznych, technicznych, artystycznych i medycznych oraz narzędzi bazodanowych. Wciąż jeszcze przyjmujemy zgłoszenie biernego uczestnictwa w Konferencji. Wszystkich zainteresowanych zachęcamy do jak najszybszego zarejestrowania się, ze względu na ograniczoną ilość miejsc w Hotelu Muzyk.

Celem konferencji "Infobazy 2005 - Bazy Danych dla Nauki" jest realizacja założeń programu rozwoju usług informatycznych, zgodnie z programami e-Polska - działań na rzecz rozwoju społeczeństwa informacyjnego oraz "PIONIER: Polski Internet Optyczny Zaawansowane Aplikacje, Usługi i Technologie dla Społeczeństwa Informacyjnego". W szczególności chodzi o upowszechnienie informacji i prezentację aktualnych osiągnięć w tworzeniu i udostępnianiu baz danych dla nauki oraz nawiązanie bliższej współpracy pomiędzy środowiskiem nauki a społeczeństwem, w tym z administracją państwową i regionalną. Liczymy, że Konferencja stanie się żywym forum dyskusyjnym, które zaowocuje szeregiem wspólnych inicjatyw oraz nowych projektów badawczych i wdrożeniowych.

Konferencja jest organizowana przy wydatej pomocy sponsorów.

Serwer czasu (NTP) został przeniesiony na nową maszynę. Serwer ma własny adres IP: 153.19.250.123. Nazwa sieciowa - ntp.task.gda.pl - pozostaje bez zmian. Zaleca się stosowanie wyłącznie nazwy, a nie adresu IP.

Zgodnie z wcześniejszą informacją serwer Usenet (NEWS) został dzisiaj przeniesiony na nową maszynę - Sun Fire V880 feluga. Na serwis przeznaczone jest 750 GB miejsca na macierzy dyskowej FC.

W czasie przełączania mogą wystąpić przejściowe problemy w postaci rozsynchronizowania czytników. Za utrudnienia przepraszamy.

Informujemy, że w CI TASK został wdrożony i oddany do użytku nowy serwer sieciowy Sun Fire V880 feluga . Serwer posiada 8 procesorów Ultra SparcIII oraz 16 GB pamięci operacyjnej i pracuje pod kontrolą systemu Solaris 10. Do serwera dołączona jest macierz dyskowa FC SunStorage 3511 o łącznej pojemności 3,2 TB.

Serwer jest podzielony na dwa wirtualne serwery (zony), każda zona ma przydzielone po 4 procesory i z punktu widzenia użytkownika działa jako zupełnie odrębny serwer sieciowy. Na jednym z tych serwerów została posadowiona usługa FTP z przestrzenią dyskową o pojemności 1,3 TB. Stanowi ponad 2,5 raza więcej niż wynosiła dotychasowa przestrzń serwera FTP.

Na drugi wirtualny serwer zostanie wkrótce przeniesiony serwis UseNet/NEWS, dotychczas zlokalizowany na korwecie .

Serwisy na nowym serwerze są dostępne również przez protokół IPv6 pod adresami ftp6.task.gda.pl oraz news6.task.gda.pl

Dziasiaj zostały wyprowadzone z serwerowni TASKu dwa serwery SGI: Chalange L kliper oraz Power Chalange galeon . Pierwszy z nich, wyposażony w cztery procesory R4400 przez dziesięc lat pełnił funkcje serwera pocztowego i dostępowego dla użytkowników KDM TASKu. Sterował także system składowania danych opartym na archwizatorach taśmowych i optycznych. W zeszłym roku został zastąpiony przez nowy serwer Sun Fire V880.

Galeon był 8-procesorowym serwerem obliczeniowym, również pracował przez blisko 10 lat. Jego moc obliczeniowa długi czas służyła symulacjom kwantowochemicznym i modelowaniu w zastosowaniach inżynierskich, jednak gwałtowych rozwój technologii spowodował, że w ostatnim czasie została pobita przez dobrze wyposażone ogólnodostępne stacje robocze.

Oba serwery nie trafią jednak od na złom lecz posłużą jako pomoc dydaktyczna w Państwowej Wyższej Szkole Zawodowej w Elblągu.

W sieci szkieletowej TASK uruchomiono pierwszy fragment działający z przepływnością 10 Gb/s. Łączy on Centrum Informatyczne TASK na Politechnice z Ośrodkiem Informatycznym Uniwersytetu. Do tej pory sieć szkieletowa TASK działała z przepływnością 1 Gb/s, a przepływność 10 Gb/s była dostępna tylko w sieci Pionier .

Dzisiejsze uruchomienie łącza CI TASK - UG jest pierwszym etapem prac polegających na wymianie urządzeń w całej sieci szkieletowej, na pozwalające osiągać przepływność 10 Gb/s. Będzie to jedno z pierwszych i największych wdrożeń sieci metropolitalnej w kraju oparte na techonologii 10 Gigabit Ethernet.

Większość sieci lokalnych działa dziś z przepływnością 100 Mb/s co jest wielkością wystarczającą do zwykłej pracy z Internetem na stacji roboczej. Jednak zwiększająca się liczba użytkowniów i stale rosnąca ilość danych przesyłanych Internetem wymusza stosowanie w sieciach szkieletowych przepływności daleko większych niż te w zwykłych stacjach roboczych. Instalacja nowych urządzeń 10 Gb/s pozwoli na podniesienie poziomu usług świadczonych przez CI TASK, a także zwiększenie ich zakresu, m.in. w dziedzinie transmisji danych głosowych i video.

Dzisiaj, w Dworze Artusa w Gdańsku odbyły się uroczyste obchody 10-lecia istnienia Trójmiejskiej Akademickiej Sieci Komputerowej. W gali prowadzonej przez Prorektora PG prof. Andrzeja Stepnowskiego wzięli udział m.in. Marszałek Województwa Pomorskiego Jan Kozłowski, Prezydent Miasta Gdańska Paweł Adamowicz, Prezydent Miasta Sopotu Jacek Karnowski, Przewodniczący Rady Rektorów Pomorza Wiesław Makarewicz, Rektor Politechniki Gdańskiej prof. Janusz Rachoń. Historię powstania TASKu oraz etapy jego rozwoju przypomnieli prof. Antoni Nowakowski - wieloletni przewodniczący Rady Użytkowników TASKu oraz Dyrektor TASKu Mścisław Nakonieczny. Podczas gali Rektor PG wręczył osobom zasłużonym dla rozwoju trójmiejskiej sieci pamiątkowe statuetki. Otrzymali je m.in. dyrektor TASKu Mścisław Nakonieczny oraz pracownicy CI TASK: Rafał Tylman, Sławomir Połomski, Krzysztof Niemczyk i Dariusz Klimowicz.

W trakcie gali odbyła się sesja naukowa poświęcona badaniom realizowanym na Komputerach Dużej Mocy w TASKu. W czasie krótkiego wykładu dr hab. Janusz Rak z Wydziału Chemii UG opowiedział o roli niskoenergetycznych elektronów w uszkodzeniach DNA, prof. Jarosław Rybicki z Wydziału Fizyki Technicznej i Matematyki Stosowanej PG omówił główne zagadnienia nanomechaniki obliczeniowej, a dr Jacek Rumiński z Wydziału Eletroniki Telekomunikacji i Informatyki PG przedstawił metody rekonstrukcji i przetwarzania obrazów.

W gali wzięło udział około stu gości: przedstawicieli samorządu terytorialnego, wyższych uczelni Trójmiasta i całego Pomorza, ośrodków sieciowo-informatycznych z całego kraju a także firm związanych z branżą teleinformatyczną. Imprezę uświetniła wystawa prac młodych artystów z gdańskiej ASP inspirowanych wizytą w serwerowni TASKu.

Od kilku tygodni trwają w TASKu prace nad wdrożeniem protokołu IPv6 w wersji natywnej, bez transportu przez inne warstwy np IPv4. Internet Protocol v.6 jest to nowy sposób adresowania i komunikacji komputerów w Sieci. U podstaw jego powstania leży ograniczenie liczby adresów w stosowanym obecnie protokole IPv4. Jednak IPv6 wprowadza wiele nowych cech m.in. zwiększenie bezpieczeństwa i efektywności przesyłania informacji. Obecnie za pomocą nowego protokołu komunikuje się część stacji roboczych oraz serwer FTP. Dla klientów obsługujących IPv6 adres ftp.task.gda.pl jest automatycznie rozwiązywany na adres numeryczny: 2001:4070:1:0:0:0:0:FAFA

Mimo sezonu urlopowego w serwerowni TASK ostatnio sporo się działo. Zakończono właśnie instalowanie dodatkowych modułów pamięci operacyjnej w klastrze holk . Dzięki temu połowa nodów jest wyposażona w aż 6 GB pamięci co zapewne na jakiś czas ucieszy chemików kwantowych oraz innych użytkowników pamięciożernych aplikacji. Obecnie całkowita pamięć nodów klastra wynosi 0,5 TB.

W ubiegłym tygodniu usługa FTP została przeniesiona z serwera sieciowego korweta (Sun) na wydzielony czteroprocesorowy intelowski serwer szkuner . Nowy serwer dysponuje pamięcią dyskową o pojemność ponad 500 GB, o 20% większą niż w porzedniej konfiguracji. Zwolnione zasoby korwety zasilą potrzeby serwisu NEWS oraz bibliotecznego serwera bazodanowego.

Migracja ma charakter tymczasowy. Serwis FTP będzie działał w takiej konfiguracji do czasu zakupu nowego dedykowanego serwera sunowskiego, co ma nastąpić za kilka tygodni.

Z dniem 06.04.2004 zmienia się numer faksu do obsługi domen internetowych : 347-14-41 . Na ten numer należy przesyłać wnioski o rejestrację domen, zmiany delegacji i danych adresowych. Numer ogólnodostępny (do sekretariatu) pozostaje bez zmian: 347-10-06.

Z dniem dzisiejszym ulegają zmianie adresy e-mailowe użytkowników Komputerów Dużej Mocy CI TASK. Adresy mające dotąd postać @task.gda.pl zostają zmienione na @kdm.task.gda.pl .

Wczoraj ukazała się 22 edycja listy najszybszych komputerów świata TOP500 . Znajdujący się w CI TASK klaster obliczeniowy holk znalzł się na niej na 231 pozycji z wynikiem 641,6 Gflops. Jest to już drugi superkomputer Centrum uwzględniony w rankingu TOP500. Pierwszym był IBM SP2 sklasyfikowany w listopadzie 1995 na pozycji 479.

Aktualnie holk jest jedynym komputerm z Polski znajdującym się w rankingu największych komputerów świata.

Dzisiaj w Centrum Informatycznym TASK został oddany do eksploatacji nowy klaster obliczeniowy przeznaczony dla środowiska naukowego.

W uroczystości oddania klastra do eksploatacji wzięli udział m.in. wiceprezes firmy Intel Stancy Smith, Dyrektor Zarządzający firmy Optimus Małgorzata Walczak, Podsekretarz Stanu w Ministerstwie Nauki i Informatyzacji Wojciech Szewko, oraz przedstawiciele władz miejskich i wojewódzkich a także reprezentanci nauki i władz akademickich trójmiejskich uczelni. Uruchomienia klastra dokonał Rektor Politechniki Gdańskiej prof. dr hab. inż. Janusz Rachoń.

Od 13.10.2003 następuje zmiana terminu konsultacji. Konsultacje będą się odbywały w czwartki w godzinach 14.00 - 15.30, w pokoju 252 w Gmachu Głównym PG.

W serwerowni CI TASK został zainstalowany nowy serwer firmy Sun. Nie jest to właściwie jedna maszyna lecz klaster serwerów Sun Fire V480 i Sun Fire V880 z dołączonymi dwiema macierzami Sun StorEdge 3510. Nowy serwer ma przejąć funkcje wysłużonego SGI Challange'a klipera . Jego głównym zadaniem będzie serwowanie plików dla serwerów obliczeniowych, obsługa poczty, kont użytkowników, oraz sterowanie archwizatorem ATL.

Podczas modernizacji sieci energetycznej serwer News uległ awarii i jest dostępny w ograniczonym zakresie. Trwaja prace nad przywróceniem pełnej funkcjonalności serwisu.

W ubiegłym tygodniu w serwerowni TASKu miały miejsce spore zmiany. Serwerownię opuścił wysłużony IBM SP2 holk . Był to jednym z pierwszych superkomputerów zainstalowanych w TASKu. Składał się z 15 procesorów POWER2 RS/6000 z zegarem 66MHz. Z mocą obliczeniową 2,81 Gflop/s znalazł sie w 1995 roku na 479 miejscu listy TOP500. Holk służył użytkownikom TASKu głównie do symulacji biocząsteczk, szkieł i półprzewodników oraz do rozwiązywania problemów matematycznych metodami algebry komputerwej.

Holk został zdemontowany i trafił do piwnicy. Serwerownię opuścił też archiwizator optyczny HP o pojemności 160 GB.

Miejsce IBM'a zajmie niedługo klaster oparty na procesorach Itanium 2. Liczymy, że jak jego poprzednik, nowy superkomputer również trafi na TOP500.

W dniu 19 sierpnia br. Cetrum Informatyczne TASK podpisało umowę z firmą Optimus na dostawę 256-procesorowego klastra obliczeniowego.

CI TASK gościło dziś wiceprezydenta Intela, odpowiedzialego za rozwój produktów serwerowych, Pana Abhijita Talwalkara. Wizyta ma związek z planowanym przez Centrum zakupem nowego klastra obliczeniowego.

Więcej...

Serwer dostępowy prowadzony przez CI TASK znowu działa. Aktualnie serwer pracuje z prędkością 33600 z pięcioma modemami.

Oficjalna strona WWW Centrum posadowiona na tym samym serwerze co FTP i NEWS została przeniesiona na inny serwer. Powinno to zapewnić szybsze ładowanie się stron.

W okresie przejściowym, do czasu kiedy zmiana adresu serwera nie zostanie rozpropagowana w DNSie może być widoczna stara wersja strony.

Dziś w nocy komputery oraz węzeł sieciowy CI TASK zostały podłączone do nowego systemu UPS. W skład nowej instalacji oprócz baterii akumulatrów wchodzi również spalinowy agregat prądotwórczy. Zapas paliwa wystarcza na podrzymanie zasilania przez 24 godziny co w praktyce czyni CI TASK niewrażliwe na jakiekolwiek przerwy w zasilaniu.

Nowa instalacja pozwoliła także podłączyć klaster, który dotąd nie był zabezpieczony przed zanikami napięcia.

Osoby stale korzystające z serwisów CI TASK zauważyły zapewne w nocy z 12 na 13 b.m. nieobecność głównego serwera korweta.task.gda.pl Wymienianiliśmy w tym czasie dyski twarde, na których rezydował system operacyjny Jednocześnie zainstalowaliśmy nową wersję systemu operacyjnego, która pozwoli lepiej wykorzystać 64-bitową architekturę maszyny.

Stare dyski i zainstalowany na nich system pracowały w korwecie prawie nieprzerwanie i tylko z niezbędnymi aktualizacjami przez 8 lat.

Dzisiaj zamontowano 8 dodatkowych twardych dysków w macierzy dyskowej Sun StorEdge dołączonej do naszego głównego serwera usługowego korweta.task.gda.pl . W ten sposób rozmiar przestrzeni dyskowej korwety wzrósł do 800 GB. Nowe dyski będą przeznaczone na usługi ftp i news . Przestrzeń na każdą z tych usług zwiększyła się o 100 GB. Pozwoli to na mirrorowanie większej ilości pakietów oraz dłuższe przetrzymywanie newsów.

CI TASK współorganizuje VIII Warsztaty Naukowe PTSK. Warsztaty odbędą sie na przełomie sierpnia i września w Gdańsku-Sobieszewie. Tematyka Warsztatów objemuje m.in. problemy symulacji komputerowych w biologi, medycynie,technologi chemicznej, automatyce,transporcie i bezpieczeństwie, poruszne też będą zagadnienia sztucznej inteligencji i sieci neuronowych oraz wykorzystania komputerów w sztuce i naukach humanistycznych. Z warsztatami stowarzyszonych jest pięć Szkół Letnich.

Centrum Informatyczne TASK uruchomiło klaster komputerowy zbudowany w oparciu o platformę sewerową Intel SC450NX. Klaster składa się z 32 węzłów, z których każdy zawiera 4 procesory Xeon 700 MHz z 1 MB pamięci cache oraz 512 MB pamięci RAM. Węzły są połączone siecią o architekturze 2D-torus firmy Dolphin o przepływności 1.6 Gb/s.

Ponieważ jest to instalacje pilotażowa, zostaną przeprowadzone testy i badania polegjące na określeniu mocy obliczeniowej, kompatybilności oprogramowania oraz wydajności w obliczeniach równoległych. Według wstępnych szacunków superkomputer będzie dysponował mocą obliczeniową rzędu od 100 do 150 GFlops.